تتمثل مهام الأرشيف الوطني في :
العمل على صيانة التراث الأرشيفي الوطني بحفظ أرصدة الأرشيف التابعة للدولة والجماعات العمومية المحلية والهيئات الخاصة المكلفة بتسيير مرفق عمومي والمأمورين العموميين.
جمع أرصدة  الأرشيف المتعلق بتاريخ تونس والموجود بالخارج وتمكين العموم من الإطلاع عليه.
جمع أرصدة الأرشيف الخاصة  و إعدادها  فنيا وإتاحتها للمستفيدين.

لمؤسسة  الأرشيف الوطني الصلاحيات التالية :
إسداء المعونة الفنية في مجال التصرف في الوثائق و الأرشيف للمرافق العمومية والهيئات المذكورة.
مساعدة  المرافق العمومية والهيئات المذكورة على إعداد برامج للتصرف في الوثائق  و الأرشيف  والمصادقة على جداول مدد الإستبقاء الخاصة بها.
مراقبة ظروف حفظ الأرشيف الجاري والأرشيف الوسيط التابع للمرافق العمومية .
تجميع  أرصدة الأرشيف النهائي الخاصة بهذه المرافق  و إعدادها فنيا و حفظها  وتمكين العموم من الإطلاع عليها.
إعداد وسائل البحث التي  تمكن المستفيدين من الإطلاع على أرصدة  الأرشيف و نشرها.
تنظيم الإطلاع على الأرشيف والعمل على تثمين قيمته الثقافية والتربوية باستعمال كل الوسائل المناسبة كالمعارض الوثائقية و التظاهرات و الندوات العلمية.

وللقيام بهذه المهام فإن مؤسسة الأرشيف الوطني تتمتع بهيكل تنظيمي استنادا إلى الأمر عدد 389 لسنة 1997 المؤرخ في 21 فيفري 1997 وذلك حسب الهيكل التنظيمي.